Tuvastatud peamised biomarkerid kõhunäärmevähi varajaseks diagnoosimiseks

Hiljutises uuringus, mis avaldati ajakirjas Cell Genomics, viis Hiina teadlaste meeskond läbi juhtumikontrolli uuringu, et analüüsida suurt seerumivalkude paneeli, et tuvastada. Valgu biomarkerid

pankreasevähi varajases staadiumis. Nad kasutasid Mendeli randomiseerimismeetodit, et hinnata nende valkude võimalikku põhjuslikku mõju kõhunäärmevähi tekkele.

Kõhunäärmevähk on vähi surmapõhjuste hulgas kolmas ja kui see diagnoositakse hilja, on viieaastane elulemus vaid 10%. Vähi avastamine selle varases staadiumis võib aga suurendada elulemust 24–37%ni. Arvestades, et kõhunäärmevähk areneb aeglaselt, algse ja invasiivse staadiumi vahel on keskmiselt 11,7 aastat, on selle varajaseks avastamiseks piisavalt aega.

Traditsioonilised vähi biomarkerid, nagu kartsinoembrüonaalne antigeen ja süsivesikute antigeenid 19–9, 125 ja 242, on näidanud pankreasevähi suhtes erinevat spetsiifilisust. Põletikulised valgud nagu tuumori nekroosifaktor (TNF), C-reaktiivne valk (CRP) ja interleukiin-6 (IL-6) ei näidanud samuti olulisi seoseid kõhunäärmevähiga.

Vereanalüüs, mis hõlmab kõiki ringlevaid valke, mida eritavad normaalsed ja kahjustatud rakud ja koed, on paljulubav meetod vähi tuvastamiseks, kuna ringlevate valkude kõrvalekalded viitavad sageli kasvajate tekkele organismis.

Selles uuringus analüüsisid teadlased potentsiaalset rühma, et tuvastada ja hinnata seerumivalgu biomarkereid, mida saab kasutada kõhunäärmevähi tuvastamiseks. Osalejate hulgas oli 44 paari vanemaid täiskasvanuid, kellel oli kõhunäärmevähk ja nende terved kontrollrühmad, vanuse, soo, verevõtu kuupäeva ja haigla järgi. Osalejate keskmine vanus oli 68,48 aastat ja 45% olid mehed. Vaatlusandmed hõlmasid ligikaudu 5,7 aastat.

Tsirkuleerivaid valke mõõdeti tühja kõhuga seerumiproovidest, kasutades läheduse pikendamise testi. Normaliseeritud valgu ekspressiooni (NPX) väärtuste abil mõõdeti ja kvantifitseeriti umbes 1500 valku. Kategooriliste muutujate tuvastamiseks võrreldi kõhunäärmevähi juhtude ja nende tervete kontrollide vahel erinevaid algnäitajaid, nagu suitsetamine, alkoholitarbimise tase, haridustase, glükeemilised indeksid ja kehamassiindeks.

Valgu ekspressiooni väärtused standarditi ja iga valgu jaoks arvutati tõenäosussuhted. Lisaks kasutati GTEx projekti ribonukleiinhappe (RNA) andmeid, et uurida iga valgu geeniekspressiooniprofiili 54 koes. Tundlikkuse analüüsid viidi läbi ka pärast andmete soo järgi kihistamist ja 2. Tüüpi diabeediga kohandamist.

Valkude võtmebiomarkerite replikatsiooni analüüsimiseks kasutati Ühendkuningriigi Biobank Pharma Proteomics Projecti andmeid. Lisaks kasutati Mendeli randomiseerimismeetodit, et hinnata tuvastatud valkude võimalikku põhjuslikku mõju kõhunäärmevähi tekkele.

Uuringus tuvastati neli pankreasevähiga seotud valku: fosfolipaas A2 rühm IB (PLA2G1B), tuumori nekroosifaktor (TNF) ja regenereeriva valgu perekonna (REG) perekonna liikmed 1A ja 1B. Nendest REG1A ja REG1B valgud kinnitati Ühendkuningriigi Biobanki andmete põhjal. Lisaks näitasid Mendeli randomiseerimisanalüüsid, mis kasutasid kogu genoomi hõlmavaid assotsiatsiooniandmeid ja kvantitatiivseid tunnuste lookusi, REG1A ja REG1B põhjuslikku mõju kõhunäärmevähi arengule.

REG1 valkude kolokalisatsioonianalüüs näitas mõõdukaid tõendeid selle kohta, et kõhunäärmevähil ja REG1 valkudel on ühine põhjuslik variant. Veelgi enam, Mendeli randomiseerimisanalüüs ei leidnud tõendeid muude põhjuslike variantide kohta, mis mõjutaksid seost REG1 valkude ja kõhunäärmevähi vahel.

REG1 valke on kõrgendatud tasemel leitud ka kopsu- ja söögitoruvähi korral. Need valgud sünteesitakse kõhunäärme Langerhansi saarekeste β-rakkudes ja osalevad diabeedi tekkes ja saarekeste rakkude regenereerimises.

Teadlased oletasid, et kõhunäärme kasvajad või kahjustused stimuleerivad β-rakkude proliferatsiooni, mis põhjustab REG1 valkude ebanormaalset sekretsiooni. Lisaks võib REG1 valkudes esinev C-tüüpi lektiini domeen seostuda kasvajarakkude pinnal olevate süsivesikutega ja soodustada pahaloomulist kasvu.

Selles uuringus uurisid teadlased ringlevaid valke, et tuvastada pankreasevähi võimalikud biomarkerid. On tuvastatud kaks valku, REG1A ja REG1B, millel on põhjuslik mõju pankreasevähi tekkele ja mis on samuti suurenenud kopsu- ja söögitoruvähi korral. Need tulemused toovad esile REG1A ja REG1B valkude potentsiaali kasutada pankreasevähi varajases avastamises ja ulatuslikus sõeluuringus.