Uuring: geenid mõjutavad puuviljade ja kiudainete vähivastast efektiivsust

Ajakirjas eBioMedicine avaldatud hiljutises uuringus tuvastati geneetilised variatsioonid, mis võivad muuta seost kiudainete, puu- ja köögiviljade tarbimise ning kolorektaalse vähi riski vahel ( CRC). Teadlased on edukalt tuvastanud kaks olulist lookust, mis vähendavad seost kiudainete ja puuviljade tarbimise ning CRC riski vahel.

CRC on üks levinumaid vähktõbe maailmas, 2020. Aastal registreeriti peaaegu kaks miljonit uut haigusjuhtu ja suri üle 900 000 inimese. Puu- ja köögiviljade, täisteratoodete ja kiudainete suur tarbimine vähendab väidetavalt haigestumise riski. CRC. Kuigi on kindlaid tõendeid seose kohta CRC riski ning täistera ja kiudainete tarbimise vahel, on tõendeid seose kohta CRC riski ning puu- ja köögiviljade tarbimise vahel endiselt piiratud.

Varasemad genoomi hõlmavad assotsiatsiooniuuringud (GWAS) on suutnud tuvastada vähemalt 200 CRC riskiga seotud lookust, mis selgitab kuni 35% pärilikkusest. Kuigi geeni-keskkonna (G × E) interaktsioonid võivad selgitada täiendavat pärilikkust, on varasemad väikeste proovide ja traditsiooniliste meetoditega tehtud uuringud leidnud vaid piiratud arvu olulisi koostoimeid. Uued statistilised lähenemisviisid, nagu ühistestid ja kaheastmelised meetodid, mis seavad esikohale ühe nukleotiidi polümorfismi (SNP), võivad potentsiaalselt parandada nende analüüside täpsust.

Analüüsi kaasati kuni 45 uuringut kolmest CRC geneetilisest konsortsiumist, sealhulgas Euroopa päritolu isikud. Uuringud hõlmasid juhtumite kontrolle kohordiuuringute jaoks ja vähivaba kontrolle juhtumikontrolli uuringute jaoks. Puu-, köögivilja- ja kiudainete tarbimise osas analüüsiti kokku 69 599, 69 734 ja 44 890 osalejat. Toidutarbimist hinnati toidu sageduse küsimustike ja toitumislugude abil, mida tavaliselt väljendati portsjonitena päevas puu- ja köögiviljade puhul ning grammides päevas kiudainete kogusisalduse kohta.

Andmed ühtlustati ja väljendati kvartiilides soo ja uuringu järgi. Lisaks hõlmas genotüpiseerimise kvaliteedikontroll puuduvate andmete, Hardy-Weinbergi tasakaalu ja soo ebaühtluse kontrollimist, millele järgnes imputeerimine ja väiksema alleeli sageduse ja täpsuse filtreerimine, mille tulemusena analüüsiti 7 250 911 SNP-d.

Võrreldes kontrollrühmadega olid CRC-ga osalejad vanemad, neil oli suurem kehamassiindeks ja suurem energiatarbimine ning suurem riskifaktorite, nagu CRC ja II tüüpi diabeedi perekonna ajalugu. Samuti tarbisid nad kontrollrühmaga võrreldes vähem kiudaineid, puu- ja köögivilju. Metaanalüüsid leidsid pöördvõrdelise seose kiudainete tarbimise (suhteline risk kvartiili suurenemise kohta (OR) = 0,79), puuviljade (OR = 0,79) ja köögiviljade (OR = 0,82) ning CRC riski vahel.

3-DF test tuvastas rs4730274 lookuse SLC26A3 geenist ülesvoolu, mis näitab seost kiudainete tarbimisega ja koostoimet CRC riskiga. Stratifitseerimine genotüübi järgi näitas tugevamat pöördühendust kiudude ja CRC vahel iga T-alleeli koopia puhul. Funktsionaalne annotatsioon viitas võimendaja aktiivsusele käärsoolekoes koos DLD geeni eQTL-iga.

Geeni NEGR1 lähedal asuv rs1620977 lookus näitas olulist seost puuviljade tarbimisega ja mõõdukat koostoimet CRC riskiga. Täheldati tugevaid pöördühendusi seoses kasvava puuviljatarbimisega G-alleeli iga koopia puhul.

Uuring on seni suurim G × E uuring, milles teadlased tuvastasid kaks koostoimet kiudainete ja puuviljade tarbimise ning CRC riski vahel. Eelkõige viitab SLC26A3 geeni lähedal asuv rs4730274 olulisele seosele kiudainete tarbimise, soolefunktsiooni, põletiku ja CRC vahel. Tulemused nõuavad täiendavaid uuringuid, et uurida kliinilisi tagajärgi ja kinnitada neid leide erinevates populatsioonides.