Ajutüvi on seljaaju jätk rostraalses suunas. Tinglik piir nende vahel on koht, kus algavad esimesed kaelajuured ja püramiidne hargnemiskoht. Ajutüvi jaguneb tagaajuks ja keskajuks. Esimesse kuuluvad piklikaju, ajusild ja väikeaju. Selle jätk on keskaju, mis koosneb nelipeakehadest ja ajuvartest ning piirneb vaheajuga (talamus, hüpotalamus, subtalamus).