Menstruaaltsükkel peegeldab hüpotalamuse-hüpofüüsi-munasarja süsteemi aktiivsust, mis väljendub reproduktiivsuse struktuursetes ja funktsionaalseid muutusi: emakas, munajuhades, endomeetriumis ja tupes. Iga tsükkel lõpeb menstruatsiooniga, mille esimesel päeval peetakse tsükli algust.