Puukentsefaliiti põhjustab flaviviirus, mida levitavad ixodid-puugid; on kirjeldatud ka värske piima kaudu nakatumise juhtumeid. Pärast 10-päevast inkubatsiooniperioodi avaldub see katarri, palaviku, peavalu, liigesevalu ja kesknärvisüsteemi kahjustustena (entsefaliit - 30%, meningiit - 60%, meningoentsefaliit - 10%). Puukentsefaliidi vastane vaktsineerimine endeemilistes piirkondades on viinud esinemissageduse vähenemiseni.