MRI uurib aju struktuuride seisundit vastavalt nende kuju, suuruse ja koe tiheduse järgi. Pane tähele, et MRI peegeldab koe tihedus funktsioonina veesisaldus ja seega esimese avastamiseks haavandeid, näiteks ajuturse-turse (ONGM), demüelinisatsioonihaiguste, kasvajad.