EEG-analüüs tehakse salvestamise ajal ja lõpuks pärast selle lõpetamist. Salvestamise ajal hinnatakse esemete olemasolu (vooluvõrgu väli fookustamine, elektroodide liigutamise mehhaanilised esemeid, elektromüogramm, elektrokardiogramm jne) ning võtavad meetmeid nende kõrvaldamiseks. Hinnatakse EEG sagedust ja amplituudi, määratakse iseloomulikud graafika elemendid, määratakse nende ruumiline ja ajaline jaotumine.