P. Jiroveci on mikroorganism, mille taksonoomiline positsioon pole määratletud. Enamik teadlasi seostab selle kõige lihtsamaga (alamtüüp Sporozoa, klass Haplospora). Kuid viimastel aastatel on andmed kogunenud, et vastavalt ribosomaalse RNA nukleotiidjärjestustele on pneumotsüüdid seentele lähemal. See on ekstratsellulaarne parasiit, mille domineeriv tropism on kopsukoes, mis mõjutab esimese ja teise järjekorra pneumotsüüdid.